嘉兴市第一医院药学部是目前全市技术力量最雄厚的综合性药学部门，承担着医院医疗、教学、科研所需的各项药学专业服务工作，下设西药房、中药房、病区药房、感染门诊药房、急诊药房、静脉配置中心、药库、临床药学及审方中心等8个部门。现有药学专业技术人员77名。

药学部在医院药事管理与药物治疗学委员会的监督指导下负责全院药品供应、质量控制、不良反应监测等，积极参与临床药物治疗，开展以合理用药为核心的临床药学工作；同时，承担起了药学专业本科生的教学实习任务。科室设有专门的临床药学实验室，配备高效液相色谱仪、电子天平等仪器，能为临床开展治疗药物的血药浓度监测，并可协助相关科室开展科研、教学、实验等工作；2018年成为嘉兴市唯一通过国家药物临床试验机构（GCP）资格认定的药物临床基地；2019年创建嘉兴市首家“审方中心”，率先开展事前审方工作，2020年成为嘉兴市唯一浙江省医疗机构审方药师培训基地；2019年临床药学成为嘉兴市医学重点扶持学科，2023年成为嘉兴市医学重点支撑学科；门诊药房实行前后台敞开式发药，不断优化电子处方系统，有效提高了药师工作的质量和效率，2018年成功创建国家级“青年文明号”，使病人满意度持续提高；静脉药物配置中心在嘉兴市首家建立，对化疗药物、全胃肠外营养（TPN）等进行集中配置；中药房在全市卫生系统率先实行中药饮片小包装化调配；病区药房2台全自动药品分包机的投入使用，为住院病人提供了更优质的药学服务。我们信奉“仁爱、敬业、务实、创新”精神，秉承“以患者为中心”的服务宗旨，倡导“安全、有效、经济、合理”的用药理念，历年来在卫生部及省市药剂质控检查评比中均有优秀表现，多次被省、市药事质控中心评为“药事质控管理优胜单位”。

科室重视学术交流，配备有完善的多媒体教学设施，近5年成功举办省级继续教育学习班8期、国家级继续教育学习班6期，多次组织市级继教班，受到广大药师的欢迎。教学方面，2018年被温州医科大学授予临床药学专业实践教学基地，同时承担了嘉兴医学院、温州医科大学本科毕业论文指导。近5年来承担各类科研课题14项，其中省自然课题1项，市科技局10项；发表各类专业学术论文26篇，其中SCI 11篇，中华及一级期刊3篇；申报新技术新项目12项；授权专利14项。